ภาควิชาชีวเคมีก่อตั้งขึ้นเมื่อปี พ.ศ. 2528 พร้อมกับคณะแพทยศาสตร์ มหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ เพื่อรองรับการเรียนการสอนระดับพรีคลินิกของวิชาชีวเคมี ในระยะแรกของการจัดตั้ง สถานที่ทำการของภาควิชาชีวเคมี ตั้งอยู่ ณ ตึก B ชั้น 3 ภาควิชาชีวเคมี คณะวิทยาศาสตร์ มหาวิทยาลัยมหิดล โดยมีศาสตราจารย์ ดร.วิชัย บุญแสง ทำหน้าที่รักษาการหัวหน้าภาควิชาชีวเคมี จนถึงปี พ.ศ. 2536 เมื่ออาคารเรียนรวมพรีคลินิกและวิทยาศาสตร์ (ตึก 15) มหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒเสร็จ จึงย้ายที่ทำการมาอยู่ ณ ชั้น 6 ตึก 15 อันเป็นสถานที่ตั้งของภาควิชาชีวเคมีจนถึงปัจจุบัน
รายชื่อหัวหน้าภาค
ศาสตราจารย์ ดร.วิชัย บุญแสง
ปี 2528 - 2536
รองศาสตราจารย์ ดร.โกสุม จันทร์ศิริ
ปี 2536 - 2545
รองศาสตราจารย์ ดร.วาสนา สุขุมศิริชาติ
ปี 2545 - 2553
รองศาสตราจารย์ ดร.รมิดา วัฒนโภคาสิน
ปี 2553 – ปีปัจจุบัน
